Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms