Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ECM1Q16610 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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ECM1Q16610 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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