Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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