Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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GABRA6Q16445 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GABRA6Q16445 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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