Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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