Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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CDSNQ15517 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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CDSNQ15517 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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CDSNQ15517 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDSNQ15517 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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