Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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