Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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SHPRHQ149N8 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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SHPRHQ149N8 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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SHPRHQ149N8 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SHPRHQ149N8 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SHPRHQ149N8 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SHPRHQ149N8 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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