Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms