Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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UBE4AQ14139 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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UBE4AQ14139 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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UBE4AQ14139 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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