Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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