Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTCH1Q13635 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTCH1Q13635 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTCH1Q13635 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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