Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRR1Q13601 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRR1Q13601 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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