Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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