Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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