Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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SKP2Q13309 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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