Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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