Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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