Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STX4Q12846 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STX4Q12846 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
STX4Q12846 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STX4Q12846 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
STX4Q12846 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
STX4Q12846 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms