Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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