Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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