Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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