Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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