Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms