Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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BRD3Q15059 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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BRD3Q15059 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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BRD3Q15059 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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