Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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