Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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