Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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