Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BFSP2Q13515 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms