Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms