Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
SP140Q13342 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SP140Q13342 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SP140Q13342 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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