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| PTK7 | Q13308 | ZPLD1-202 | ENST00000466937 | 1531 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | SENP7-202 | ENST00000348610 | 3272 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | LUZP2-207 | ENST00000533227 | 5016 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | OXR1-206 | ENST00000449762 | 2621 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC024940.1-206 | ENST00000632817 | 4299 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTK7 | Q13308 | LINC02120-201 | ENST00000505518 | 2008 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AL592291.1-201 | ENST00000403830 | 352 nt | BASIC | 4.98 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTK7 | Q13308 | PTPRD-203 | ENST00000381196 | 9911 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.98 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | POSTN-210 | ENST00000541481 | 3113 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.98 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | DLG1-217 | ENST00000452595 | 3053 nt | TSL 2 BASIC | 4.98 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTK7 | Q13308 | ABCA12-201 | ENST00000272895 | 9100 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | CNGA1-203 | ENST00000420489 | 2746 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | CPHL1P-201 | ENST00000461341 | 3407 nt | BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | RASAL2-203 | ENST00000462775 | 14453 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | FOXP2-220 | ENST00000634411 | 4065 nt | TSL 5 BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF705A-204 | ENST00000610508 | 3378 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | TMEM71-210 | ENST00000523829 | 1974 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD81.1-201 | ENST00000363064 | 77 nt | BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AL024508.1-201 | ENST00000432477 | 505 nt | TSL 2 BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AL365434.2-201 | ENST00000607979 | 234 nt | BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | AP001282.2-201 | ENST00000616149 | 309 nt | BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTK7 | Q13308 | XIST-204 | ENST00000429829 | 19275 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |