Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CBX3Q13185 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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