Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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