Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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