Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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