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| CNTN1 | Q12860 | AL513328.1-201 | ENST00000446460 | 224 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP000477.2-201 | ENST00000447405 | 778 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | C1DP4-201 | ENST00000455429 | 424 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL133481.3-201 | ENST00000456546 | 333 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SRIP1-201 | ENST00000489235 | 288 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC139453.3-201 | ENST00000493276 | 369 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SUMO2P6-201 | ENST00000505273 | 288 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RN7SKP298-201 | ENST00000515950 | 94 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-143P-201 | ENST00000516942 | 93 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC022695.3-201 | ENST00000523385 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CNTN1 | Q12860 | AC024909.2-201 | ENST00000553035 | 286 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL132819.1-201 | ENST00000555595 | 208 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL391840.1-201 | ENST00000571144 | 367 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC098848.2-201 | ENST00000588023 | 330 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC068790.2-201 | ENST00000602601 | 557 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL512643.1-201 | ENST00000635735 | 524 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CNTN1 | Q12860 | ELF1-201 | ENST00000239882 | 3566 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MLF1-203 | ENST00000392822 | 2157 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC008669.1-201 | ENST00000565823 | 2178 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SLC4A7-201 | ENST00000295736 | 7757 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZBTB8OSP1-201 | ENST00000342688 | 498 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CNTN1 | Q12860 | Y_RNA.367-201 | ENST00000365544 | 101 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-108P-201 | ENST00000365558 | 107 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | EQTN-201 | ENST00000380031 | 725 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU1-73P-201 | ENST00000383971 | 164 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | TRAJ40-201 | ENST00000390497 | 61 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL139095.1-201 | ENST00000404326 | 391 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LINC00301-202 | ENST00000412599 | 772 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC005009.1-201 | ENST00000423979 | 269 nt | TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL096799.1-201 | ENST00000425900 | 381 nt | TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC005019.2-201 | ENST00000434321 | 359 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC013727.2-201 | ENST00000447761 | 545 nt | TSL 4 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC126182.1-201 | ENST00000478134 | 357 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPS27AP10-201 | ENST00000496103 | 208 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AIG1P1-201 | ENST00000503376 | 148 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC116562.3-201 | ENST00000506136 | 177 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC109927.2-201 | ENST00000506416 | 303 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CNTN1 | Q12860 | RNU6-445P-201 | ENST00000516949 | 107 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SMIM18-201 | ENST00000517349 | 905 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP003122.3-201 | ENST00000526316 | 255 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CNTN1 | Q12860 | AC068587.5-201 | ENST00000528506 | 175 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC084851.1-201 | ENST00000529105 | 249 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC090023.1-201 | ENST00000545750 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC020661.3-201 | ENST00000558101 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PCLAF-207 | ENST00000559519 | 749 nt | TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC027176.1-201 | ENST00000560204 | 514 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC073648.5-201 | ENST00000603502 | 305 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR15A-201 | ENST00000607334 | 83 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC012409.4-201 | ENST00000612923 | 249 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC138649.3-201 | ENST00000622154 | 254 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093648.1-201 | ENST00000623546 | 606 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CR381653.2-201 | ENST00000624041 | 768 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR6733-201 | ENST00000635723 | 61 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MGST1-207 | ENST00000535309 | 1331 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SKIL-203 | ENST00000426052 | 2757 nt | TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL589740.1-207 | ENST00000607823 | 1962 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC103710.2-202 | ENST00000641454 | 2853 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CCPG1-203 | ENST00000442196 | 3453 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ANKAR-209 | ENST00000520309 | 4410 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZNF470-202 | ENST00000391709 | 6601 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RGS13-204 | ENST00000543215 | 1518 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | TBC1D15-210 | ENST00000485960 | 2489 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-1097P-201 | ENST00000363586 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU4-24P-201 | ENST00000364565 | 139 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-61P-201 | ENST00000365528 | 109 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA4.3-201 | ENST00000365564 | 137 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | XGY1-201 | ENST00000381172 | 446 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-74P-201 | ENST00000384235 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL445529.1-201 | ENST00000398713 | 389 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP003170.3-201 | ENST00000399123 | 158 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | NDUFS5P4-201 | ENST00000412983 | 318 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL158840.1-201 | ENST00000414132 | 523 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CNTN1 | Q12860 | AC080125.1-201 | ENST00000414888 | 684 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC009158.1-206 | ENST00000417476 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL138737.1-202 | ENST00000418834 | 876 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | USP9YP20-201 | ENST00000419224 | 558 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC016710.1-201 | ENST00000421326 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CNTN1 | Q12860 | RNU6-123P-201 | ENST00000516163 | 102 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTCYBP20-201 | ENST00000524239 | 1129 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |