Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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