Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms