Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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