Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
VPREB1P12018 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms