Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LRRTM2O43300 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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