Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VGFO15240 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
VGFO15240 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VGFO15240 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
VGFO15240 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
VGFO15240 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VGFO15240 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VGFO15240 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VGFO15240 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VGFO15240 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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