Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms