Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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USP18Q9UMW8 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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USP18Q9UMW8 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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USP18Q9UMW8 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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USP18Q9UMW8 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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