Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSRB1Q9NZV6 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSRB1Q9NZV6 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms