Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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