Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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