Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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PTPROQ16827 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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