Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CTF1Q16619 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CTF1Q16619 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CTF1Q16619 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CTF1Q16619 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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