Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GRIK5Q16478 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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